Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfaP20033 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms