Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnnc1P19123 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms