Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RargP18911 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RargP18911 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RargP18911 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RargP18911 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RargP18911 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms