Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gata1P17679 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms