Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp53P15975 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp53P15975 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp53P15975 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp53P15975 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms