Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rag1P15919 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms