Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnc1P15388 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms