Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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