Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms