Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf2P09926 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms