Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spta1P08032 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spta1P08032 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spta1P08032 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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