Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd4P06332 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd4P06332 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd4P06332 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd4P06332 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms