Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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