Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2-Eb1P04230 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms