Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HbaP01942 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HbaP01942 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HbaP01942 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HbaP01942 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HbaP01942 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HbaP01942 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HbaP01942 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HbaP01942 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HbaP01942 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HbaP01942 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HbaP01942 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HbaP01942 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HbaP01942 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HbaP01942 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HbaP01942 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HbaP01942 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HbaP01942 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HbaP01942 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HbaP01942 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HbaP01942 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HbaP01942 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HbaP01942 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HbaP01942 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HbaP01942 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HbaP01942 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HbaP01942 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HbaP01942 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HbaP01942 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HbaP01942 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms