Protein–RNA interactions for Protein: P01807

Ig heavy chain V region X44, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01807 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01807 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01807 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01807 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01807 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01807 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01807 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01807 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01807 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01807 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01807 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01807 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01807 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01807 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01807 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01807 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P01807 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01807 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01807 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01807 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01807 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms