Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01669 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01669 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01669 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01669 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01669 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01669 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01669 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01669 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms