Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01668 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01668 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01668 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01668 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms