Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01664 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01664 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
P01664 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01664 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01664 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01664 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01664 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01664 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01664 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01664 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01664 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms