Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClppO88696 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClppO88696 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClppO88696 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClppO88696 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ClppO88696 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ClppO88696 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClppO88696 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClppO88696 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClppO88696 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClppO88696 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClppO88696 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClppO88696 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClppO88696 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClppO88696 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClppO88696 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClppO88696 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms