Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnmt3bO88509 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms