Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms