Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vti1bO88384 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vti1bO88384 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vti1bO88384 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vti1bO88384 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vti1bO88384 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vti1bO88384 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vti1bO88384 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vti1bO88384 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms