Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xirp1O70373 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms