Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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