Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkbO70126 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AurkbO70126 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms