Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx4O55187 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms