Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlx3O55144 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tlx3O55144 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlx3O55144 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlx3O55144 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms