Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp2a2O55143 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2a2O55143 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2a2O55143 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2a2O55143 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2a2O55143 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2a2O55143 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2a2O55143 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp2a2O55143 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms