Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrxO55103 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrxO55103 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrxO55103 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrxO55103 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrxO55103 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrxO55103 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrxO55103 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrxO55103 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrxO55103 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrxO55103 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrxO55103 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrxO55103 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrxO55103 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrxO55103 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrxO55103 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrxO55103 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrxO55103 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrxO55103 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrxO55103 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms