Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb2O55029 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms