Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc3O55013 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms