Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LatO54957 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LatO54957 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LatO54957 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LatO54957 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LatO54957 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LatO54957 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LatO54957 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LatO54957 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms