Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn5O54942 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn5O54942 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn5O54942 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn5O54942 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn5O54942 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 738.5 ms