Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms