Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms