Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edil3O35474 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edil3O35474 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms