Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms