Protein–RNA interactions for Protein: O35459

Ech1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ech1O35459 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ech1O35459 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ech1O35459 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ech1O35459 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms