Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd2O35392 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms