Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn1O35350 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn1O35350 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn1O35350 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn1O35350 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn1O35350 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn1O35350 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn1O35350 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn1O35350 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms