Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hs3st1O35310 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hs3st1O35310 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms