Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd2O35245 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms