Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms