Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncoa3O09000 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms