Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms