Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlyrefO08583 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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