Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
U90926O08546 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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U90926O08546 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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U90926O08546 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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U90926O08546 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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U90926O08546 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
U90926O08546 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
U90926O08546 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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