Protein–RNA interactions for Protein: K9J7H2

Gm4141, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4141K9J7H2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4141K9J7H2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms