Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms